第二阶段为推进提高阶段（2012-2015年）。全面落实各县有机畜牧业发展规划和产业群及功能区建设发展规划，实现产业升级，转变经济增长方式，提高技术服务水平，优化产业结构，强化经济效益，加强有机产品认证。主要任务为：进一步完善有利于有机畜牧业发展的支撑保障条件；建设具有相当规模、条件良好的标准化基地；打造以欧拉羊、藏系羊、黑牦牛为主的有机畜产品知名品牌；着力培育产业集群，集中力量发展一批畜产品精深加工企业，有机产品加工企业同国内外市场接轨；全州建成有机畜牧业生产核心区，缓冲隔离区向周边地区延伸，以龙头企业为主体的有机产品开发向周边地区进行较大规模的辐射；通过国家有机畜产品生产基地州建设考核。河南县及泽库县东部地区2012年前完成，泽库县西部地区、同仁县、尖扎县2015年前完成。
第三阶段为全面达标和提升与完善阶段（2016-2020年）。有机畜牧业基地全面达到国家认证标准（《国家有机食品生产基地考核管理规定》），全州经济社会与人口、资源、环境协调发展，生态环境质量得到根本改善，生态经济建设进一步深化，资源的高效利用和循环利用体系得到建立。建立起符合可持续发展要求的经济结构、产业体系、生态环境体系和社会管理体系，建成资源高置换化、产业高效益化、流通高节能化、环保高质量化、社会高和谐化，具有西部特色和高原特色的有机畜牧业示范基地。河南县、泽库县东部地区2018年前完成，泽库县西部地区、同仁县、尖扎县2020年前完成。
二、生产区域布局和特色种群划分
（四）生产区域划分。河南县生产区域划分以《河南县有机畜牧业发展规划》为标准进行划分。
有机畜牧业生产饲草饲料区。包括河南县优干宁镇和托叶玛乡两个乡镇，泽库县宁秀乡、和日乡、王家乡、巴滩牧场、麦秀镇，同仁县瓜什则、扎毛、曲库乎乡。发展方向和重点任务为：稳定牲畜数量，保护和改良天然草场，提高产草量，加强草原基础设施建设，建设有机畜牧业生产饲草料基地。宁秀乡、和日乡、王家乡、巴滩牧场及瓜什则乡主要以种植禾本科有机牧草为主，麦秀镇、扎毛乡、曲库乎乡以种植豆科有机牧草为主，发展有机饲草饲料加工业。建立饲草饲料加工厂，以加工青干草为主，为有机畜牧业生产基地提供饲草饲料保障。同时，种植高营养豆科牧草的地区，逐渐可延伸到同仁、尖扎二县浅脑山地区。2010至2015年完成。
牲畜舍饲生产区。该区包括河南县宁木特、托叶玛、赛尔龙、柯生、多松等乡，泽库县多禾茂、西卜沙、宁秀、和日、王家、泽曲等乡镇，同仁县多哇、瓜什则乡。发展方向和重点任务是：以有机畜牧业生产提供饲草饲料保障，改变黄南州牧区牲畜只在秋季集中出栏的局面，达到四季均衡出栏。且以出售当年羔羊和犊牛为主，形成规模，逐步推行舍饲，一至二年内使牲畜舍饲天数达到60天，三至五年内逐渐增加到150天，以满足有机畜牧业产业化发展的需求。
