根据对2006年财政经济形势的分析，编制2006年市本级财政预算总的指导思想是：以邓小平理论和“三个代表”重要思想为指导，全面、深入贯彻党的十六大和十六届三中、四中、五中全会精神，按照建设和谐深圳、效益深圳的要求，继续依法加强收入征管，科学安排收入计划；认真贯彻落实产业第一、效率优先的原则，大力支持产业结构调整和经济增长方式转变；进一步优化支出结构，重点保障政权运作、科教、文化、社会保障、公共卫生等方面的支出需求；继续深化财政改革，加强制度创新，提高财政资金使用的规范性、有效性；加强政府债务管理，控制债务风险；灵活、有效地运用各项财政政策，促进经济社会协调和可持续发展。
三、关于2006年市本级财政预算编制的原则
（一）积极稳妥地安排收入计划，保障经济社会发展对财力的需求。全市和市本级财政收入增长水平应与本市生产总值增长水平相适应。在收入安排上既要积极，又要稳妥；既要立足于全市经济社会发展大局，保障我市经济社会发展对财力的需求；又要实事求是地分析收入增长中的有利和不利因素，科学判断各项政策调整对收入增长的影响。要全面、准确地编列各项财政收入预算，将上年结转结余全部纳入当年财政安排，编足编实上级补助收入。进一步强化“收支两条线”管理，推进综合预算。
（二）切实贯彻产业第一的原则，努力建设效益深圳。充分利用我市改革开放积累的成果，舍得投入，努力建设效益深圳。进一步加强对企业自主创新的支持，提高产业的核心竞争力。继续安排重大项目发展资金，增强产业发展后劲和经济持续发展能力。把支持第三产业发展放在突出的位置上，认真落实金融产业发展政策，推进我市区域性金融中心建设；继续支持现代综合物流体系的发展；加大文化产业的支持力度。继续加大我市重大基础设施建设的投入，发挥政府投资对经济发展的拉动作用。
（三）优先保障重点支出，确保市委、市政府战略决策和重点工作的落实，推动和谐深圳建设。全面落实科学发展观，按照建设和谐深圳和公共财政的要求，进一步优化支出结构，确保市委、市政府战略决策和重点工作的落实。要优先保障政权运转；认真落实我市“1＋5”人口政策，提高外来人口公共管理和服务水平；继续加大对教育的投入力度，理顺对教育投入的保障机制，确保教育投入不低于经常性财政收入增长速度，大力支持民办教育发展，改善基层教育发展条件，促进教育的均衡化发展；继续加大对科学、文化、公共卫生等各项社会事业发展的支持力度；努力保障我市“净畅宁”、“清无”等专项整治行动支出需求，提高城市管理水平；认真落实“我市食品安全监督管理的议案”，加大食品安全方面投入，努力提高人民生活水平；进一步加大就业、优抚救济等社会保障的投入，促进社会和谐；加大对循环经济的支持力度，建设节约型社会，打造环境友好城市。
（四）严格部门预算约束，实事求是地做好行政事业性经费安排。坚决贯彻市委市政府勤俭办一切事业的指示精神，除政策性等刚性增支外，各预算单位一般项目经费实行零增长。加强部门预算编制管理，各预算单位必须实事求是编报部门预算，不得留硬缺口。强化部门预算观念，规范临时请款资金的安排和使用。认真落实审计整改意见，改进部门预算的编制方式方法。加强各预算单位年度结转结余的管理。
