一是对重要生态功能区实施抢救性保护。重点是建立生态功能保护区，实行严格保护下的适度利用和科学恢复。重要生态功能区包括江河源头区、重要水源涵养区、水土保持的重点预防保护区和重点监督区、江河洪水调蓄区、防风固沙区和重要渔业水域等，这些区域对保持流域、区域生态平衡，确保国家生态环境安全方面具有特别重要的作用。
二是对重点资源开发的生态环境实施强制性保护。当前，重要自然资源的无序、不合理开发是造成我国生态环境不断恶化的主要原因。《纲要》进一步明确了水、土、草原、森林、海洋、生物、矿产等自然要素的生态功能，要求加大立法执法力度，强化监管，防止重要自然资源开发时对生态环境造成新的重大破坏，把资源开发对环境的破坏降低到最低限度。
三是对生态良好地区生态环境实施积极性保护。主要通过批建自然保护区，开展生态示范区、生态市、生态省的建设，积极引导，努力实现生态环境良好地区社会经济健康、持续发展，生态环境良性循环；生物多样性丰富地区得到有效保护。
《纲要》中生态环境保护的目标、任务和措施，主要是围绕这“三区”工作重点来提出，并考虑了与《全国生态环境建设规划》的协调和衔接。
四、《纲要》有那些新特点？
土地、水、森林、草原、野生生物、矿藏等本身既是重要的自然资源，又是基本的生态环境要素和生态系统，这就使得资源管理与生态保护既相互促进，又相互制约。为减少和避免自然资源开发造成新的生态破坏，《纲要》的政策特点为：
一是突出对自然资源作为重要生态环境要素或生态系统的生态功能的保护；
二是强调资源开发对相关生态环境要素和生态系统的影响，其强调了对加强保护的要求；
三是注意保护的系统性，把自然资源开发利用的各个环节所产生的各类生态环境问题综合起来考虑。
另一方面，《纲要》所提出的目标、任务和对策，是在国家现有环境保护和资源管理框架下，根据党中央、国务院加强生态环境保护的新要求，以及国内国际环境保护新形势、新问题提出的，集中体现了我国政府今后一个时期对生态环境保护的基本观点和要求，并首次明确提出了“维护国家生态环境安全”的生态环境保护目标。
五、《纲要》提出了那些新措施？
《纲要》力求在生态环境保护的对策上有所突破，对重点生态问题，实行更加严格的监控和保护措施。主要有：
