第九条 农业系统部门内部审计机构，对行业经济管理中的专项资金和重要财务收支问题，开展行业审计或审计调查。
农业系统专项资金和重要财务收支问题的审计或审计调查，实行分级组织实施办法。全国农业系统(行业)的专项资金和重要财务收支问题的审计或审计调查，由驻农业部审计局负责组织实施；地方农业系统(行业)的专项资金和重要财务收支问题的审计或审计调查，由省级主管部门审计机构负责组织实施。
第十条 农业系统内部审计的工作成果，经测评后，可以作为审计机关、社会审计组织等工作的参考依据。
第十一条 在审计管辖范围内，内部审计机构的主要权限是：
(一)根据内部审计工作的需要，要求有关单位按时报送计划、预算、决算、报表和有关文件、资料等。
(二)审核凭证、账表、决算，检查资金和财产，检测财务会计软件，查阅有关文件和资料。
(三)参加部门、单位的年度计划、预决算、基建项目、对外投资、联营合资合作等的研究和立项经济活动的有关会议。
(四)对审计涉及的有关事项进行调查，并索取有关文件、资料等证明材料。
(五)对正在进行的严重违反财经法规、损失浪费的行为，报部门或单位领导人同意后，作出临时制止决定。
(六)对阻挠、妨碍审计工作，以及拒绝提供有关资料的，经部门、单位领导人批准，可以采取必要的临时措施，并追究有关人员的责任。
(七)提出改进管理、提高效益的建议和纠正、处理违反财经法规行为的意见，经领导人批准下达审计结论和处理决定。
(八)对严重违反财经法规、严重损失浪费行为的直接责任人员，向领导人或有关部门提出处理的建议，并按有关规定，向上级内部审计机构或者审计机关反映。
(九)部门、单位可以在管理权限范围内，授予内部审计机构对违反财经法规的经济处理和处罚权限。处理和处罚款项，交同级财务部门或部门、单位领导批准的部门管理。
(十)对严格遵守和维护财经法规的单位和个人，向部门、单位领导人提出给予表彰和奖励的建议。
第十二条 内部审计工作的主要程序。
(一)根据上级部署和本部门、本单位的具体情况，拟订审计项目计划，报经本部门、本单位领导人批准后实施。
(二)实施审计前，应当通知被审计单位。
