科学论文是科学技术产出的一种忠实记录，刊物的影响因子和论文的被引用频次，在用于宏观上判断科学技术产出的总体情况是有意义的，但不宜作为具体论文内在价值的判断标准。要提倡内在价值的判断，正确看待SCI（科学引文索引）、EI（工程索引）等数据库在科学技术评价中的作用。SCI、EI等收录论文数量只是科学技术评价中的定量指标之一，反对单纯以论文发表数量评价个人学术水平和贡献的做法，强调论文的被引用频次，并根据不同学科领域区别对待，避免绝对化。
六、提倡务实评价，营造宽松的创新环境，避免过繁过重的科学技术评价活动
科学技术评价应该有利于营造宽松的创新环境，激励科技工作者勇于从事原始性创新研究。要优化评价程序，改进评价方法，注重评价实效，尽可能地压缩合并相同内容、不同层次的评价活动，减轻被评机构及人员的负担，避免过繁过重的评价妨碍科学技术活动的正常进行。要建立跨部门的国家科技计划和项目管理信息系统，促进政府各部门之间的协同工作，保证评价数据与信息的公开与共享，避免不必要的重复。
对人员的评价是为了向研究开发人员提供正确的支持意见和改进建议，为研究开发人员的工作创造一个宽松稳定的环境，激励研究开发人员进行更有成效的研究开发活动，避免导致急功近利的短期行为。人员评价要遵照分类评价的原则，根据其所从事岗位和工作的性质，确定相应的评价标准。要注重对科技人员群体的评价，重点考察学术带头人的创新能力和潜力、学术水平、实际贡献及其在研究群体中所发挥的作用等，群体内部人员的评价应由学术带头人去考察。要淡化职称评价，重视岗位聘用。评价周期应结合岗位的工作性质而设定，避免产生短期效应。对机构的评价要侧重诊断性评价，强调科研机构与基地的开放、流动及共享服务，重点评价其发展战略、学科优势与特色、国际地位与竞争力、创新能力与水平、队伍建设、人才培养等。对连续评价为优秀的机构和研究群体，可适当延长其评价周期。
七、加强科学道德建设，营造良好的创新文化，坚决反对任何形式的学术不端行为
将创新文化的重要要素引入到评价体系之中，加强科学道德建设，倡导热爱科学、淡泊名利的良好文化风尚。要鼓励勇于创新、宽容失败、敢为人先的拼搏精神。弘扬“百花齐放、百家争鸣”的方针，提倡开展平等的学术批评与学术争论，保障不同学术观点的公开发表和充分讨论。推动不同学科领域、不同学术思想、不同学派间的交流与合作，营造有利于科技发展的良好文化环境。
