应用研究的评价应紧密结合经济建设和社会发展的需求，以技术推动和市场牵引为导向，以技术理论、关键技术、共性技术和核心高技术的创新与集成水平、自主知识产权（专利、版权、标准、专有技术等）、潜在的经济效益、社会效益等要素为主要评价标准。
科技产业化的评价以建立企业为主体的科技成果转化与产业化机制，发展高新技术产业，优化调整产业结构为导向，以培育具有自主创新能力的高新技术企业为评价重点，以产品的技术先进性和创新性、及其未来的产业化水平和发展前景为主要评价标准。这类科学技术活动要以市场评价为主，对这类科学技术活动的评价应注意吸收经济学家、管理专家及产业界人士的意见。
四、坚持“公平、公正、公开”的评价原则，建立与国际接轨的评价制度，规范科学技术评价行为
科学技术评价要客观、真实、准确地反映不同评价对象的实际情况，增加科学技术评价活动的公开性与透明度，保证评价工作的独立性和公正性，评价结果的科学性和客观性。在评价实施过程中，政府不组织机构排序，不干预具体评价工作。
在建立健全评价专家资格审查制度的基础上，进一步完善国内外专家库的建立与共享，提高来自研究开发第一线中青年评价专家的比例。在评价工作中，严格实行回避制度与专家组定期轮换制度。积极推进国际同行评议，尤其对国家重要研究机构、研究领域或学科及重大项目的评价要邀请国外专家参与。建立评价意见的反馈机制、评价申诉制度以及重大项目评价结果公示制度。加强评价专家信誉制度建设，重大项目的评审应采取记名投票方式，评价专家名单应分级分类向社会公开，增强评价专家的荣誉感和社会责任感。
公平对待“小人物”和“非共识”项目。对探索性强、风险性高的项目和创新性强的“非共识”项目应淡化对项目有关研究基础、可行性分析的评价，为创新性“非共识”项目提供探索性小额资助的机会，促进创新人才脱颖而出，鼓励原始性创新活动。
五、倡导质量第一，克服浮躁、急功近利等短期行为, 坚决反对浮夸作风
科学技术评价始终要将质量放在第一位，鼓励和引导科技人员开展具有创新意义的科研工作。对机构和个人（或群体）重点评价具有代表性的突出成绩和典型事件，不得以数量代替质量。
加强对科技成果评价工作的管理，树立国家科技成果评价的严肃性、权威性和公正性。改进现行成果评价方式，采用国际通行的同行评议和专家推荐制。科技评奖应以是否具有重大科技创新、重大技术进步，阐明自然现象、特征和规律，做出重大科学发现，以及在相应领域、学科内产生影响等实质性的价值标准作为重要指标，避免滥用不切实际的“国际领先”、“国内领先”等夸大之辞，坚决抵制和反对虚假评价。要制定严格的监督机制和责任制度，一旦发生虚假评价的情况，要追究评价机构及相关人员的责任。
