1、县级卫生行政部门要指派疾病预防控制机构专业人员进驻指定开设发热门诊的乡镇卫生院和县级医院，以及指定的县级传染性非典型肺炎治疗定点医院，同医疗机构接诊医师、防保人员共同开展工作，负责临床诊断的病例或疑似病例的报告和流行病学调查工作。按照《传染性非典型肺炎流行病学调查指导原则》要求，逐项填写“传染性非典型肺炎病例（包括疑似病例）个案调查表”。
　　2、每个病例的调查原则上要由两人共同完成。对病例进行个案调查时，尽可能由病人自己回答调查者所提的问题，收治病人的医疗机构和医护人员要积极配合，并如实提供病人相关诊疗资料。如病人因病情较重或已死亡，无法实施对病人的直接调查时，应通过其亲友、同事或其他知情人了解情况，完成调查。
　　3、病例调查时，要认真、详细地了解和记录患者发病后到过的地方、乘坐过的交通工具和与其有过密切接触的人员的有关情况。
　　4、疑似病例确诊、病人痊愈出院或死亡时，收治病人的医疗机构要将病人的诊断、转归情况报告所在地疾病预防控制机构，同时要登记姓名、病历编号、国标码、住院号资料，纳入当地疫情报告系统。必要时疾病预防控制机构要进行随访调查。
　　5、调查完毕后，应该在24小时以内将调查内容通过“传染性非典型肺炎个案调查报告管理信息系统”逐级上报。不具备条件的地区，要立即以最快的通讯方式将调查表报至上级疾病预防控制机构。
　　6、调查时要注意的问题
　　(1)对病人及其密切接触者调查时，调查员要按照医务人员接触诊疗传染性非典型肺炎病人个人防护的有关要求，做好个人防护。
　　(2)调查时要尽量减少对临床诊疗活动的干扰。
　　(三)接触者的追踪和管理
　　1、接触者的追踪调查。
　　疾病预防控制机构要按照《传染性非典型肺炎流行病学调查指导原则》要求，及时开展对病例接触者的追踪和调查，逐项填写“传染性非典型肺炎病例密切接触者调查表”，及时将调查内容录入“传染性非典型肺炎个案调查报告管理信息系统”传输和逐级上报。
　　2、接触者的医学观察和隔离。
　　(1)如发现密切接触者已出现传染性非典型肺炎可疑症状时，应立即通知指定机构派专用救护车将其接入定点医院隔离诊治，并按病例开展个案调查。
　　(2)疾病预防控制机构要根据调查获得的与病例接触的方式、频度、场合、场所等详细情况和已经明确的该疾病传播方式和传播特点的有关知识，对接触者受到感染的危险性进行分析和判断。对一般的接触者，要告知注意事项，如有不适，立即到医疗机构就诊；对密切接触者要隔离和医学观察14天（从与病例最后接触之日算起）。

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