第十七条 项目申报。中央与地方联建项目的项目建议书、可行性研究报告等项目材料，由各省、自治区、直辖市及计划单列市农业行政主管部门内的计划管理部门负责组织编制，并以计字号文同时报送农业部发展计划司和行业主管司局。部直属单位基本建设项目的项目建议书、可行性研究报告、建设方案、初步设计等项目材料，由各单位以正式文件报送农业部发展计划司，同时抄送行业主管司局。所有项目建议书、可行性研究报告一律用A4纸报送。
第十八条 项目评估。大中型和限额以上项目的项目建议书、可行性研究报告、扩初设计由发展计划司组织初评后报国家计委。小型和限额以下项目的可行性研究报告、扩初设计由发展计划司组织专家或委托有相应资质的工程咨询机构进行评估和审核。有特殊规定的项目从其规定。
第十九条 项目审批。大中型和限额以上项目的项目建议书、可行性研究报告、扩初设计由发展计划司初审后，报国家计委审批。小型和限额以下项目的项目建议书、可行性研究报告，由行业主管司局初审并提出意见后，报发展计划司审批。小型和限额以下的中央与地方联建项目的设计方案、初步设计和概算由各省、自治区、直辖市及计划单列市农业行政主管部门或同级计划管理部门审批；小型和限额以下的部直属单位基本建设项目的设计方案、初步设计及概算，由发展计划司根据专家或工程咨询机构评估意见并征求行业司局的意见进行审批。
第二十条 项目可行性研究报告总投资超过批准的项目建议书总投资10％（含10％）以上，或扩初设计概算的总投资超过批准的可行性研究报告总投资10％（含10％）以上的，要按照审批权限重新向原审批机关报批项目建议书或可行性研究报告；施工图预算超过批准的扩初设计概算投资5%以上的，须重新向原审批机关报批扩初设计文件。
第二十一条 中央与地方联建的跨区域或全国性布局的项目，部各行业主管司局应以专项项目形式编制项目建议书、可行性研究报告，明确建设目标、建设内容、项目布局、投资规模、建设期限等内容，报发展计划司审批后，分年度实施。
第五章 年度投资计划
第二十二条 年度投资计划不搞切块、不定基数，实行按项目安排投资，按项目建设进度下达投资计划并进行拨款。
第二十三条 建设项目必须完成全部前期工作（在京直属单位的建设项目还须向北京市建委申请建房计划；中央与地方联建项目必须落实地方配套资金和建设单位自有资金，出具省、自治区、直辖市及计划单列市计划、财政或金融部门的项目配套资金承诺函件），并按规定程序获得批准后，方可列入年度投资计划。
第二十四条 年度投资计划的编制。部基本建设年度投资计划总体方案由发展计划司统一编制。发展计划司根据国家产业政策和投资政策，农业发展中长期规划和年度计划，以及农业部确定的投资重点，在国家计委安排农业部年度投资计划总量内，在综合有关行业主管司局意见的基础上，经综合平衡，于每年9月份向国家计委编报下一年度农业基本建设投资计划草案，并于每年3月底前编制提出本年度农业基本建设投资计划总体方案，报部常务会审批。
