第三阶段，整顿登记阶段；５月２５日至７月２０日前，完成整顿和全部现有互联网上网服务营业场所重新审批登记工作。对符合
《办法》要求的上网营业场所，按照
《办法》规定程序重新办理登记；对不符合审批要求或在７月２０日前未办理审批注册手续的，一律予以取缔。
第四阶段，７月２０日至７月底，完成总结工作。各地通信管理局负责汇总部门清理整顿情况并报信息产业部，由信息产业部起草总结报告，经各相关部局会签后上报国务院。
四、明确审批和处罚流程
对场所的审批和对其违规行为的处罚，是此项管理工作最主要的两个环节，明确其工作流程有利于各部门之间加强协作、提高审批效率和场所经营者办理有关手续。依据
《办法》，审批流程和处罚流程明确如下：
（一）审批：场所经营者凭工商部门《企业名称预先核准通知书》和ＩＳＰ接入意向证明，向县级以上（含县级）公安机关和文化部门提出申请，分别获得互联网上网服务营业场所安全审核批准文件和《网络文化准营证》后，再向省（自治区、直辖市）通信管理局申请核发《经营许可证》，最后向县级以上（含县级）工商部门申请核发《营业执照》。
各省、自治区、直辖市有关部门可根据
《办法》的规定，结合本地区、本部门实际情况，确定相应的审核内容。
（二）处罚：各地电信管理、公安、文化、工商部门发现违规行为并进行核实后，根据职责分工交由当地相关主管部门依据
《办法》及有关法律法规予以处罚。对互联网上网服务营业场所做出撤销批准文件、吊销经营许可证或营业执照的处罚决定，处罚结果应及时通报其他相关管理部门。
五、结合各项管理工作，标本兼治
各地开展此项清理整顿工作，应与当前正在开展的互联网信息服务业务（ＩＣＰ）、电子公告服务（ＢＢＳ）的审批清理工作紧密结合起来，一旦发现ＩＣＰ、ＢＢＳ有违规情况的，同样要对其网站依法严肃处理。只有将上述各项管理工作结合进行，才能标本兼治，保证场所治理工作的成果得到全面有效的巩固。
重新审核登记工作结束后，各互联网接入业务经营单位对未获得经营许可证和营业执照的互联网上网服务营业场所，一律不得提供互联网接入服务，一旦发现违反此规定，将依法追究该经营单位及其负责人的责任。同时应采取必要技术手段遏制有害信息的传播，一旦发现违规情况立即报告有关主管部门。主管部门对“网吧”中违规者作出行政处罚决定后，有关互联网接人业务经营单位应及时依法予以配合执行。
