２．经费与任务、编制挂钩。凡一部分经费与任务关系密切，而另一部分经费应按编制必须予以保证的单位，可分别采取两种方法核定经费。一是核定科研课题经费，即按科技主管部门下达的科研计划和与研究所签订的科研项目协议，逐项计算完成课题研究所需业务经费，一项一定；或核定业务费，即按任务确定业务经费，一年一定。二是核定编制人员经费，即按每个工作人员综合费用定额和编制人数，计算单位工作人员经费。当年核定的课题研究经费或业务费，加工作人员经费即为单位全年预算包干经费。实行此种方式的有研究所、计算中心、地名档案馆等，军队离退休干部接待站筹备阶段也实行此方式。
３．核定经费基数，比例递增。即在包干第一年按单位编制人数和工作任务、经费定额核定经费包干基数，以后根据单位的性质、事业发展要求和财力可能，核定经费年递增比例，每年按比例增加包干经费。实行此种方法的有部机关的事业经费支出。
四、预算包干结余计算
１．凡经费与任务挂钩的全额单位：
年末经费包干结余＝上级主管部门核定包干经费－正常经费银行支出数
（注：上级主管部门核定包干经费＝全部预算经费－专项资金拨款）
２．凡经费与任务挂钩的差额单位：
年末经费包干结余＝上级主管部门核定补助包干经费＋本单位自行组织业务收入－［全部经费银行支出数－专项资金支出］
（注：上级主管部门核定补助包干经费＝全部预算经费－专项资金拨款）
３．凡经费与任务、编制挂钩的科研单位：
年末经费包干结余＝［上级主管部门核定人员包干经费－人员经费银行支出数］＋［本年完成课题原核定经费数－本年完成课题银行支出业务费］
４．凡经费与任务、编制挂钩的其他单位：
年末经费包干结余＝［上级主管部门核定人员包干经费－人员经费银行支出数］＋［本年核定业务费－本年银行支出业务费］
５．下年经费包干结余返还数和补拨数计算：
①下年经费包干结余返还数＝年末限额拨款注销数
②下年经费包干结余补拨数＝上级主管部门核定包干经费［或人员经费＋课题业务经费数，或补助包干经费数］－［本年实际拨款数－本年专款资金拨项］
五、经费预算包干结余的使用
１．实行“经费预算包干”办法的单位，年末经费包干结余全部留归单位，结转下年继续使用。其中５５％提作事业发展基金；２０％提作集体福利基金；２５％提作奖励基金。包干结余中有免税所得的收入，应全部提作事业发展基金，不得提作福利和奖励基金。
