（四）各级大检查办公室对大检查中重点查出的各类违反财经法纪问题，要向被查单位下发《检查结论和处理决定》。对各级大检查办公室发出的《检查结论和处理决定》，被查单位必须遵照执行。如有异议，应在接到《检查结论和处理决定》之日起１５天内，报告大检查办公室重新研究处理，也可按财政部门的复议程序申请行政复议。在重新研究或办理行政复议期间，原《检查结论和处理决定》应予执行。
（五）大检查查出的各种应缴违法违纪款项，必须按照分税制财政体制，分别缴入中央财政或地方财政，不得混库，不得以任何借口少缴或不缴。被查出来的各种应缴违纪款项，必须全额缴入国库；个别单位资金确有困难，一时难以缴清的，必须订出缴款计划，在报经做出处理决定的检查机关核实批准后，分期分批缴清，不能少缴或不缴。如有拒不缴库的，可通知银行依法划拨扣缴。各级银行对汇缴的违纪款项不得占压。
（六）各级业务主管部门在重点检查组进点之前，要积极组织力量对所属单位进行重点抽查。
（七）委托地方查出中央企事业单位应缴的违法违纪款项，可按其实际缴入中央财政的违法违纪金额，按规定给地方财政以一定比例分成。地方所得分成收入，年终由中央财政返还，纳入地方财政预算管理，在弥补大检查经费不足以后，用于发展社会公益事业，不得挪作他用。如有违反，要严肃处理。
有关委托地方检查中央单位及分成问题，按
财政部《关于委托地方检查中央单位有关事项的通知》办理（另发通知）。
（八）对大检查中清理补缴的欠税问题，一般不作违纪处理。但对未经批准或超过批准期仍拖欠国家税款的，除将其欠缴税款如数追缴财政外，还要从滞纳之日起按日加收２‰的滞纳金。
（九）在大检查查出的违反财经法纪问题中，凡需追究当事人责任的，除按规定对当事人进行经济处罚外，还要按照干部管理权限，建议有关部门给予党纪、政纪处分；凡属会计人员对违法违纪活动知情不举或者通同作弊的，应撤销其会计人员的专业技术资格。对触犯刑律的，要及时移交司法机关立案查处。
对阻挠、破坏检查的单位和个人，可视情节轻重给予通报批评，或经本级人民政府同意后，采取其他处罚措施。
要坚决保护坚持原则的检查人员、财会人员和举报人，决不允许对他们进行任何形式的打击报复，如有打击报复的，应查明情况，严肃处理。
六、大检查需要重点抓好的几项主要工作
