四、在实施环境保护目标责任制中，各级环境监测站的主要任务，一是要充分发挥环境质量监测工作和多年积累数据资料的作用，运用科学的综合分析方法，掌握本地区的环境质量状况和变化趋势，为政府部门制定科学的环保目标提供依据；二是要强化对污染源特别是重点污染源的监测，掌握必要的数据资料，分别为制定重点污染源削减主要污染物排放量控制方案和检查削减量执行情况提供依据和报告；三是要根据科学的监测结果，为上级政府部门对环境保护责任目标达标情况的考核验收工作提供依据。
环境保护监测站在向本地环保行政主管部门提交重点污染源名录时，要依据１９８５年为基准年的工业污染源调查中水、气、固体和有害废弃物、噪声污染所占等标污染负荷的６５％、７５％、和８５％排序，同时还要考虑污染源在本地经济建设中的地位、该源排放物的去向（是否城市上风向、水源上游等敏感区）和是否排放毒性大、难降解的特异污染物等因素综合确定。
五、在实施城市环境综合整治定量考核制度中，各城市环境监测站要按照有关规定开展监测工作，上报监测数据。参加国家城市环境综合整治定量考核的城市环境监测站，要认真执行国家环保局的有关规定，其他城市的环境监测站，要执行各省环境保护行政主管部门的有关规定。
六、在实施排污许可证制度中，环境监测站负责对污染源的排污申报内容进行技术核查，为污染物总量分配方案和制定排污许可证允许排污量提供科学依据，对排污单位执行许可证规定排放量情况按规定进行监督、抽测，定期向主管部门报告结果；此外，地方环境监测站还应按照当地环保行政主管部门的要求进行其他有关的各项监测和技术监督与服务工作。
七、在实施污染集中控制措施中，各级环境监测站在当地环保行政主管部门的安排下，做好工业污染源调查档案资料的综合分析工作，为制定、实施集中控制计划提供依据。
要集中抓好烟尘控制小区、型煤化区域、城市和工业污水集中处理场、固体和有害废弃物处理场等集中控制污染措施效果的监测，把集中控制区域或集中处理措施的污染源监督监测与整个区域环境质量改进趋势的监测结果进行对比、综合分析，提出本地区集中控制措施效果报告及改进建议。
八、在实施污染限期治理措施中，各级环境监测站参与治理方案的制定、负责治理效果的检查。
