在资金投入上，实行企业自筹为主，财政补助为辅，主管部门适当配套的多形式投资方式。
第五条 补助经费按项目进行管理：
（一）矿山企业根据本办法第三条、第四条规定，认真编报矿产资源保护项目经费补助申请。申请报告要对项目的编制依据、可行性论证、技术水准、投资总额及当年投资预算、经济效益与社会效益等情况予以简要说明，并附可行性研究报告，同时填制年度矿产资源保护项目补助经费申请表（表式见附一），报主管部门。
（二）各主管部门要组织对矿山企业上报的矿产资源保护项目进行认真、严格的审查评价，对符合条件的予以汇总（表式见附二），并提出资金配置方案（附矿山企业保护项目申请），于每年１２月２０日前向财政部报送下一年度项目的申请报告。
（三）财政部根据各主管部门报送的项目情况，经审核筛选、综合平衡后，下达矿产资源保护支出年度预算。
（四）各主管部门根据年度预算向财政部请领资金，并负责将资金及时拨付到位。
第六条 为加强对矿产资源保护项目的管理，做好项目的鉴定与验收工作，矿山企业可从项目补助经费中提取一定比例的管理费，但最高不得超过项目补助经费的３％。
第七条 补助经费的财务会计处理、决算编报执行现行企业财务会计制度的有关规定。项目完成后，对补助经费中属于按规定准予核销的部分，须报经财政部批准后予以核销；其余部分作为国家投资，列入资本公积金。
第八条 补助经费必须专款专用，不得截留和挪用。矿山企业应按经批准的项目具体组织实施，未经财政部批准，不得随意变更。项目完成后，由各主管部门组织验收，接受财政部的检查监督。
对违反规定的，一经查出，要追究有关人员责任，将截留或挪用经费全额收缴中央财政，并停拨或核减以后年度的补助经费指标。
第九条 各主管部门要加强对矿产资源保护经费的管理，督促经费的合理、有效使用，并于每年１２月底将所属矿山企业的项目完成进展情况及经费使用情况报告财政部。
第十条 本办法由财政部负责解释。
第十一条 本办法自发布之日起施行。
