25、
水利工程建设项目施工分包管理暂行规定（1998年11月10日水利部水建管〔1998〕481号发布，已经2005年7月22日水利部水建管〔2005〕304号发布的《
水利建设工程施工分包管理规定》废止）
26、
库区建设基金项目管理办法（1999年3月19日水利部水移〔1999〕133号发布，已经2003年3月24日水利部水移〔2003〕113号发布的《
中央直属水库移民遗留问题处理规划实施管理办法》废止）
27．
水利前期工作投资计划管理办法（1999年6月24日水利部水规计〔1999〕333号发布，已经2006年2月14日水利部水规计〔2006〕47号发布的《
水利前期工作投资计划管理办法》废止）
28、
部直属单位基础设施建设投资计划管理暂行办法 （1999年7月4日水利部水规计〔1999〕353号发布，已经2004年3月4日水利部水规计〔2004〕29号《水利部直属单位基础设施建设投资计划的管理暂行办法》废止）
29、
水利工程造价工程师资格管理暂行办法（1999年10月29日水利部水建管〔1999〕590号发布，已经2005年7月8日水利部令第25号发布的《
水利部关于修改或者废止部分水利行政许可规范性文件的决定》废止）
30、
水利工程建设监理规定（1999年11月9日水利部水建〔1999〕637号发布，已经2006年12月18日水利部令第28号发布的《
水利工程建设监理规定》废止）
31、
水利工程建设监理单位管理办法（1999年11月9日水利部水建〔1999〕637号发布，已经2006年12月18日水利部令第29号发布的《
水利工程建设监理单位资质管理办法》废止）
