部将组织做好对交通部科学研究院、广西海事局等单位原任领导的离任经济责任审计，对中国船级社现任领导进行任期期中经济责任审计，并加大对部属单位开展任期年度审计和期中审计工作的检查和指导力度。
三、继续加强财务收支审计。各单位要继续以检查经济活动的真实性、合法性、效益性为基础，以促进加强预算和资金管理为重点，认真开展财务收支审计工作，及时发现管理工作中的薄弱环节，查处经济活动中的违法违规行为和商业贿赂行为。加强投资和所办“三产”的监督检查，严肃查处私设“小金库”等严重违纪违规问题，不继规范投资和“三产”经营行为，提高投资效益。
四、深入开展经济效益审计。各单位要按照增收节支、节能减排的要求，继续有重点地选择一些单位和项目开展经济效益审计和绩效评价工作，积极提出有关工作建议，促进管理水平和经济效益的提高，促进国有资产保值增值。注意把效益审计与经济责任审计、管理审计、风险审计有机地结合起来。努力提高效益审计的质量和水平。要加大经济效益审计力度，力争经济效益审计在全部审计工作量中的比重有较大幅度提高。
部属各单位至少要安排1项经济效益审计工作，并于2008年10月底前将审计资料报部（审计办）。部将及时开展经济效益审计指导检查工作。
五、积极开展管理审计。开展管理审计要以风险为导向，注重揭示风险，查找薄弱环节，帮助分析原因、完善制度，促进管理层加强内部控制和提高管理能力。同时，要正确处理好控制风险与增加效益之间的关系，促进二者协调发展。认真总结和推广以前年度探索管理审计的经验和方法，逐步扩大管理审计的工作领域，进一步提高管理审计工作水平，切实发挥管理审计的作用。
六、继续搞好后续审计。要高度重视和认真做好审计决定（意见）的落实和审计成果的运用工作，建立审计决定（意见）执行、采纳情况的信息反馈制度。注意加大与财务、人事、纪检监察等部门的协调与配合，共同做好有关工作。
部将对2007年完成的部分审计項目的审计决定（意见）落实情况进行后续审计。
七、有效开展专项审计调查。要充分发挥审计调查针对性强、组织方便、操作可行、投入较少和易见成效的优势，及时了解行业政策法规的执行情况和重大决策的落实情况，及时发现行业管理中存在的薄弱环节和带有普遍性、倾向性的问题，及时反映基层单位的困难，及时提出审计整改意见和建议。
